Departamenti i Toksikologjisë dhe Cilësisë

Ky departament është i përbërë nga 3 sektorë

a) Sektori i Toksikologjisë dhe Mbetjeve.

Ky sektor ka në përbërje të tij laboratorët;

Laboratori i mbetjeve të medikamenteve veterinare.

Laboratori i mbetjeve të metaleve të rënda.

b) Sektori i Vlerësimit të Cilësisë së Ushqimeve.

Ky sektor përbëhet nga këto laboratorë;

Laboratori i drithrave dhe nënprodukteve të tij

Laboratori i qumështit dhe nënprodukteve të tij.

Laboratori i verës dhe pijeve alkoolike.

Laboratori i vajit, yndyrnave bimore dhe konservave të produkteve bimore të përpunuara

Laboratori i ujrave dhe produkteve të tjera ushqimore.

c) Sektori i Analizave të PMB-ve.

Ky sektor perbehet nga :

Laboratori i  rregjistrimit të pesticideve.

Laboratori i vlerësimit të lëndës aktive.